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Schulungsübersicht
Einführung in Fiji und ImageJ
- Überblick über Fiji und seine Anwendungen in der wissenschaftlichen Forschung
- Verständnis der Architektur von ImageJ und Plugins
- Installation und Einrichtung von Fiji für optimale Leistung
Grundlegende Bildverarbeitungstechniken
- Bildaufnahme und Importformate
- Anpassen von Kontrast, Helligkeit und Anwenden von Filtern
- Bildstacking und Projektionsmethoden
Fortgeschrittene Image Analysis
- Segmentationstechniken: Schwellwertverfahren und Kantenerkennung
- Zählung von Objekten und Teilchenanalyse in histologischen Proben
- Messen von Flächen, Rändern und anderen morphologischen Merkmalen
Arbeit mit Biologischen Proben
- Verarbeitung von Bildern histologischer Gewebe, Blutkörperchen und Algen
- Farbdekonvolution und Analyse gefärbter Gewebe
- Zeitrafferauswertung und Verfolgung der Zellbewegung
Automatisierung und Anpassung
- Erstellen und Ausführen von Makros für wiederkehrende Aufgaben
- Nutzung von Fiji Plugins für spezialisierte Analysen
- Grundlagen der Programmierung mit ImageJ Macro Language (IJM)
Dokumentation und Berichterstattung
- Exportieren von Ergebnissen und Erstellen von Berichten
- Kennzeichnen von Bildern und Vorbereiten von Daten für die Veröffentlichung
- Beste Praktiken für reproduzierbare Bildanalyse
Zusammenfassung und weitere Schritte
Voraussetzungen
- Grundverständnis der Konzepte biologischer Bildgebung
- Kenntnisse in Mikroskopie und histologischen Techniken
- Grundlegende Computerkenntnisse
Zielgruppe
- Forscher im Bereich Biotechnologie und Umwelttoxi-kologie
- Laboratoriumstechniker, die mit histologischen und zellulären Bildgebungen arbeiten
- Wissenschaftler, die an quantitativer Bildanalyse interessiert sind
14 Stunden
