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Schulungsübersicht
Einführung in Fiji und ImageJ
- Überblick über Fiji und seine Anwendungen in der wissenschaftlichen Forschung
- Verständnis der Architektur und Plugins von ImageJ
- Installation und Einrichtung von Fiji für optimale Leistung
Grundlegende Techniken der Bildverarbeitung
- Bildaufnahme und Importformate
- Anpassung von Kontrast, Helligkeit und Anwendung von Filtern
- Bildstapelung und Projektionsmethoden
Fortgeschrittene Bildanalyse
- Segmentierungstechniken: Schwellwertbestimmung und Kantendetektion
- Zählung von Objekten und Partikelanalyse in histologischen Proben
- Messung von Flächen, Umfängen und anderen morphologischen Merkmalen
Arbeiten mit biologischen Proben
- Verarbeitung von Bildern histologischer Gewebe, Blutzellen und Algen
- Farbdekonvolution und Analyse von gefärbten Geweben
- Zeitrafferanalyse und Verfolgung von Zellbewegungen
Automatisierung und Anpassung
- Erstellung und Ausführung von Makros für repetitive Aufgaben
- Nutzung von Fiji-Plugins für spezielle Analysen
- Grundlegendes Scripting mit der ImageJ Macro Language (IJM)
Datenverwaltung und Berichterstattung
- Export von Ergebnissen und Erstellung von Berichten
- Anmerkung von Bildern und Vorbereitung der Daten für die Veröffentlichung
- Best Practices für reproduzierbare Bildanalyse
Voraussetzungen
- Grundlegendes Verständnis der Konzepte der biologischen Bildgebung
- Vertrautheit mit Mikroskopie und histologischen Techniken
- Grundlegende Computerkenntnisse
Zielgruppe
- Forscher im Bereich der Biotechnologie und Umwelttoxikologie
- Laboranten, die mit histologischer und zellulärer Bildgebung arbeiten
- Wissenschaftler, die sich für quantitative Bildanalyse interessieren
14 Stunden
